Hälsa

Farmakogenetisk screening

Ett farmakogenomiskt test som utvärderar genetiska varianter som påverkar läkemedelsmetabolism, effekt, toxicitet och individuell respons på behandling.

 Kontakta oss

Beskrivning

iLab Medical Farmakogenetisk screening använder Next-Generation Sequencing (NGS) och hel-exomsekvensering (WES) för att utvärdera genetiska varianter som påverkar läkemedelsmetabolism, farmakokinetik, farmakodynamik och individuell respons på läkemedel.

Farmakogenomisk variation bidrar i hög grad till individuella skillnader i läkemedelseffekt, toxicitet och biverkningar. Genetiska polymorfismer som påverkar läkemedelsmetaboliserande enzymer, transportproteiner och läkemedelsmål kan förändra behandlingsutfall och öka risken för behandlingssvikt eller allvarliga biverkningar.

Testet är utformat för vårdgivare, sjukhus, precisionsmedicinska program och laboratorier som vill stödja genotypstyrt val av läkemedel och doseringsstrategier.

Till skillnad från standardiserade förskrivningsmodeller hjälper farmakogenetisk screening till att identifiera kliniskt relevanta genetiska faktorer som påverkar läkemedelssäkerhet och behandlingsrespons inom flera terapiområden.

FÖR LABORATORIER

Kardiovaskulära läkemedel, psykiatriska läkemedel, onkologiska terapier, smärtbehandling, genotypstyrd förskrivning samt riskbedömning av biverkningar.

Fördelar

Stödjer genotypstyrt val av läkemedel och dosering
Minskar risken för biverkningar
Förbättrar den terapeutiska effekten inom flera läkemedelsklasser
Ger kliniskt relevant klassificering av metaboliserarstatus
Stödjer säkrare förskrivning inom kardiologi, psykiatri, onkologi och smärtvård
Möjliggör mer individanpassad långsiktig läkemedelsbehandling

Bearbeta

Provtagning sker med perifert venöst blod som samlas i EDTA-rör. Rensat genomiskt DNA kan också accepteras som alternativt provmaterial när kvalitetskraven är uppfyllda.

Efter att provet mottagits bearbetas DNA för hel-exomsekvensering och bioinformatisk analys med fokus på kliniskt relevanta farmakogener. Varianterna tolkas i relation till aktuella farmakogenomiska riktlinjer och rapporteras med relevans för läkemedelsbehandling där det är tillämpligt.

Slutrapporten stödjer precisionsförskrivning genom att identifiera genetiska faktorer som kan påverka effekt, toxicitet, doseringsbehov och risk för biverkningar inom flera läkemedelsklasser.

FÖR LABORATORIER

Provkrav

Provtyp

  • Perifert venöst blod

Provrör

  • EDTA-rör (lila kork)

Volym

  • 2–4 mL helblod

Hanteringsinstruktioner

  • Förvaras vid 2–8 °C om provet inte bearbetas omedelbart
  • Undvik hemolys
  • Transporteras enligt riktlinjer för molekylär diagnostik
  • Rensat genomiskt DNA kan accepteras som alternativ
  • Rekommenderad DNA-mängd: 1 µg
  • Rekommenderad koncentration: 100–250 ng/µL
  • Rekommenderad A260/A280-kvot: 1,8–2,0

Svarstid (TAT)

  • Cirka 6–9 veckor från mottaget godkänt prov

Klinisk nytta

  • Precisionsförskrivning
  • Minskad risk för biverkningar
  • Optimering av terapeutisk effekt
  • Förbättrad patientsäkerhet
  • Långsiktig planering av läkemedelsbehandling

Begränsningar

  • Alla läkemedels-geninteraktioner är ännu inte fullständigt kartlagda
  • Miljöfaktorer, samsjuklighet och läkemedelsinteraktioner måste också beaktas
  • Tolkningen bör alltid integreras med klinisk bedömning

Hur det fungerar

Efter provtagning extraheras DNA och analyseras med hel-exomsekvensering på en NGS-plattform. Analysen omfattar kodande regioner i centrala farmakogener som är involverade i läkemedelsmetabolism, transport och målrespons.

Analysen inkluderar kliniskt relevanta varianter i fas I-enzymer, fas II-enzymer, läkemedelstransportörer samt receptorer och signaleringsgener som utgör läkemedelsmål. Identifierade varianter tolkas enligt etablerade farmakogenomiska ramverk och evidensbaserade referenskällor.

Slutrapporten innehåller kliniskt relevanta genotypfynd och, där det är tillämpligt, klassificering av metaboliserarstatus såsom långsam, intermediär, normal, snabb eller ultrasnabb metaboliserare. Resultaten stödjer säkrare förskrivning och mer individanpassade behandlingsbeslut.

FÖR LABORATORIER

Metodik

  • Hel-exomsekvensering med hjälp av en Next-Generation Sequencing-plattform
  • Täckning av kodande regioner i kliniskt relevanta farmakogener
  • Tolkning baserad på CPIC-riktlinjer, PharmGKB-databasen och DPWG-rekommendationer
  • Klassificering av metaboliserarstatus där tillämpligt

Analyserade gener och varianttyper

Täckning av farmakogener

  • Fas I-enzymer inklusive gener i CYP450-familjen
  • Fas II-enzymer inklusive TPMT, UGT och NAT2
  • Läkemedelstransportörer inklusive SLCO1B1 och ABC-transportörer
  • Läkemedelsmål i form av receptorer och signaleringsgener

Detekterade varianttyper

  • Singelnukleotidvarianter (SNV)
  • Små insertioner och deletioner (indels)
  • Utvalda kopietalsvariationer (CNV) där tillämpligt

Kliniska användningsområden

Kardiovaskulära läkemedel

  • Trombocythämmande läkemedel inklusive respons på klopidogrel
  • Antikoagulantia inklusive warfarinrelaterade varianter
  • Risk för statinassocierad myopati
  • Betablockerare och antiarytmika

Psykiatriska läkemedel

  • Antidepressiva inklusive SSRI, SNRI och TCA
  • Antipsykotika
  • Stämningsstabiliserande läkemedel
  • Anxiolytika

Onkologiska terapier

  • Fluoropyrimidiner
  • Tiopuriner
  • Irinotekan
  • Målriktade terapier som påverkas av metabola signalvägar

Smärtbehandling

  • Opioidmetabolism
  • Aktivering av kodein och tramadol
  • NSAID-metabolism
  • Risk för otillräcklig analgetisk effekt eller läkemedelstoxicitet
Farmakogenetisk screening
Konsultation för kliniker